Около 14 часов 26 февраля 1957 г., во вторник, в отдел расследования убийств городского управления полиции Филадельфии обратился молодой человек, пожелавший сделать заявление об обнаружении трупа. Явившийся назвался Фредериком Бенонисом, 26 лет, студентом колледжа ЛаСалль. Он утверждал, что накануне около 15.15 в пустынном местечке Фокс Чейз, на севере Филадельфии, возле дороги известной как «Саскуэханна-роад», нашел большую картонную коробку, внутри которой увидел раздетый труп ребенка.
Возле этой могилы каждый год 26 февраля и 27 июля стали собираться люди, так или иначе вовлеченные или увлеченные расследованием гибели мальчика. В группе энтузиастов, на протяжении десятилетий приходивших на эту могилу, были упоминавшиеся выше врачи Спеллман и Бристоу, профессор Крогман, сотрудники полиции и прокуратуры. Помимо лиц, непосредственно занятых расследованием, в числе энтузиастов появились и совершенно посторонние, но неравнодушные люди, занимавшиеся розыском в свободное время и за собственные деньги. В числе таковых увлеченных людей можно назвать Сеймура Шубина, потратившего 32 года на частные розыски и написавшего в конце-концов одно из самых интересных исследований о деле «мальчика в коробке». Даже спустя десятилетия ряды энтузиастов пополнялись молодыми людьми, так или иначе узнавшими об этой криминальной загадке. Филадельфийское общество «Видок», занимающееся частными расследованиями загадочных преступлений и объединяющее отставных работников правоохранительных органов и журналистов, дважды в год возлагает на могилу «мальчика в коробке» цветы.
С захоронением тела ребенка розыски не прекратились. Следствие решило, что называется, зайти с другой стороны и заняться проверкой всех людей, переехавших в Филадельфию или окрестности города в период с декабря 1956 г. по февраль 1957 г. включительно. Почти не было сомнений в том, что ребенок и его родители не проживали в городе сколь-нибудь продолжительное время, иначе непременно бы нашлись люди, вспомнившие их. На протяжении второй половины 1957 г. и первой половины 1958 г. были проверены 763 семьи, принадлежавших к белой расе и переехавших в Филадельфию зимой 1956-57 гг. Несмотря на кропотливое и дотошное исследование всех обстоятельств жизни этих людей, ничего подозрительного полиции обнаружить не удалось.
Параллельно с этим, следствие отрабатывало возможную причастность к гибели «мальчика в коробке» разоблаченных убийц детей. В 1959 г. полиция штата Вирджиния установила личности людей, спрятавших в лесу труп 6-летней девочки, завернутый в одеяло. Хотя судмедэкспертиза доказала естественность смерти ребенка, которая последовала в результате двусторонней пневмонии, полиция провела быстрое и эффективное расследование, в ходе которого было установлено, что труп девочки спрятали ее родители — Кеннет и Ирэн Дадли. Хотя против Дадли не были выдвинуты обвинения в убийстве дочери, полиция Филадельфии долгое время проверяла их на возможную причастность к делу «мальчика в коробке».
В 1960 г. под дотошную полицейскую проверку попала Маргарет Мартинеза, убившая в штате Колорадо 3-летнюю дочь. Тело девочки было найдено на свалке в большой картонной коробке. Местная полиция сумела выйти на след 30-летней мамаши, умышленно путавшей следы и упорно все отрицавшей после ареста. Выяснилось, что Мартинеза приехала в Колорадо из Пенсильвании, где одно время жила в Филадельфии. Погибшая девочка родилась в январе 1957 г., что прекрасно соответствовало полицейской версии о возможном появлении в семье убийц (или убийцы) второго ребенка, для которого на складе в Аппер-Дерби покупалась плетеная кроватка. Психологический портрет жестокой и циничной Маргарет Мартинезы и некоторые обстоятельства ее жизни до такой степени точно соответствовали предположениям следователей, что из Пенсильвании в Колорадо был командирован детектив Джозеф Комарник, которому надлежало отработать перспективную гипотезу, что называется, на месте. Несмотря на недоверие полиции, Мартинеза сумела убедительно доказать свое alibi; ее непричастность к гибели «мальчика в коробке» была установлена с абсолютной надежностью.